Počeci prirodoslovne muzejske djelatnosti u Dubrovniku datiraju još iz 1872. godine, kada je osnovan Domorodni muzej (Museo Patrio). Uz zbirku Trgovačko-obrtničke komore, njegov je temelj bila privatna prirodoslovna zbirka Antuna Dropca. Muzejski fundus je u prvoj polovici 20. stoljeća upotpunio Baldo Kosić zbirkama ptica, riba, vodozemaca, gmazova i sisavaca dubrovačkoga kraja.Tijekom prošlosti Muzej je više puta mijenjao lokacije, a od 2009. godine svoja je vrata ponovno otvorio, u prostorima Androvićeve palače u staroj gradskoj jezgri. U okviru privremenog stalnog postava izložene su najvrijednije prirodnine iz fundusa. Također je do danas u Muzeju upriličeno i mnoštvo vlastitih te gostujućih izložbi. U lokalnoj zajednici Muzej je prepoznat i po projektima muzejske edukacije te uključivanju javnost u različite segmente svoga djelovanja.